你大概有点错误。在北京有“武警总部医院”，正式名称为“武警总医院”，属于武警总部管辖。还有武警北京总队医院（也是武警北京总队第一医院），属于武警北京总队管辖；武警北京总队第二医院，属于武警北京总队二师管辖‘；武警北京总队第三医院，属于武警北京总队三师管辖。请你弄清楚后再说有什么不一样。
中国武警总医院直属国家武警总部（武警部队的最高领导机关）。目前已发展成为集医疗、保健、教学、科研、救援于一体的大型现代化综合性三级甲等医院。武警北京总队医院直属北京武警总队。也是一所集医疗、科研、教学、预防、保健于一体的三级甲等综合性医院。
两者就是隶属关系不同，医院的武警部队中的等级不同。
是一样的，一个医院，叫法不同而已
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