A、由于着丝点分裂，所以形成的1与4、2与5、3与6为相同染色体，A错误；B、该细胞处于减数第二次分裂后期，正常情况下，分裂结束形成2个完全相同的子细胞，B错误；C、该细胞分裂结束后，由于每个子细胞中不含同源染色体，所以只含有一个染色体组，C正确；D、若1号染色体上某一位点的基因为A，正常情况下，由于复制关系，所以4号染色体上相应位点的基因为A，D错误．故选：C．
