A、分子、原子都能直接构成物质,例如二氧化碳是由分子构成的,而铁是由原子构成的,故A错误;B、由分子构成的物质,分子是保持物质化学性质的最小粒子,故B错误;C、在化学变化中,分子可以再分,原子不能再分,故C错误;D、分子是由原子构成的,故D正确.故选:D.